Lanternfish Diaphus spp. specimens of a DNA barcoding survey of the mesopelagic micronekton communities of the New Caledonia and Wallis-and-Futuna EEZ - LARA - Libre accès aux rapports scientifiques et techniques Accéder directement au contenu
Rapport (Rapport De Recherche) Année : 2022

Lanternfish Diaphus spp. specimens of a DNA barcoding survey of the mesopelagic micronekton communities of the New Caledonia and Wallis-and-Futuna EEZ

Résumé

This document includes 25 plates of annotated photographs of lanternfish Diaphus spp. specimens collected during cruises ESSCHA, NECTAlis, PUFFAlis and WALLAlis of R.V. Alis in the Coral Sea, the Fiji Basin, and the Pacific Ocean around Wallis-and-Futuna Islands. Specimens were grouped by operational taxonomic unit, defined (OTU) as the cluster to which they belonged in a phylogenetic tree of sequences of a portion of the CO1 gene. Species assignment was initially based on the morphological identification of reference specimens, i.e., particularly-well preserved specimens that exhibit the diagnostic characters mentioned in diagnoses and iden-tification keys from the published literature. In several instances, the same species was represented by distinct OTUs.
Ce document comprend 25 planches de photographies annotées de spécimens de poissons-lanternes du genre Diaphus récoltés lors des campagnes ESSCHA, NECTAlis, PUFFAlis et WALLAlis du R.V. Alis dans la mer de Corail, le bassin des Fidji et l'océan Pacifique autour des îles Wallis-et-Futuna. Les spécimens ont été regroupés par unité taxonomique opérationnelle (OTU), définie comme le groupe auquel ils appartenaient dans un arbre phylogénétique des séquences d'un fragment du gène de la CO1. L'attribution à l’espèce a initialement été faite à partir de l'identification morphologique de spécimens de référence, c'est-à-dire de spécimens particulièrement bien conservés qui présentent les caractères diagnostiques mentionnés dans la littérature. Dans plusieurs cas, la même espèce était représentée par des OTUs distinctes.
Fichier sous embargo
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Année Mois Jours
Avant la publication
samedi 8 février 2025
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samedi 8 février 2025
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Dates et versions

hal-03689635 , version 1 (07-06-2022)
hal-03689635 , version 2 (21-01-2023)

Identifiants

  • HAL Id : hal-03689635 , version 2

Citer

Philippe Borsa, Damien Lagrange, Laurent Millet, Elodie Vourey. Lanternfish Diaphus spp. specimens of a DNA barcoding survey of the mesopelagic micronekton communities of the New Caledonia and Wallis-and-Futuna EEZ. [Research Report] Institut de recherche pour le développement (IRD); Aix-Marseille Université; Secretariat of the Pacific Community. 2022. ⟨hal-03689635v2⟩

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