Indexing De Bruijn graphs with minimizers

Indexation de graphe de De Bruijn basee sur les minimisers

Camille Marchet (1) , Maël Kerbiriou (2) , Antoine Limasset (3, 4)

1 GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics
2 LMB - Laboratoire de Mathématiques de Besançon (UMR 6623)
3 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
4 CRIStAL - Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille - UMR 9189

Domaines: Bio-informatique [q-bio.QM]

Camille Marchet, Maël Kerbiriou, Antoine Limasset. Indexing De Bruijn graphs with minimizers. Recomb-Seq 2019 - 9th RECOMB Satellite Workshop on Massively Parallel Sequencing, May 2019, Whashinton, United States. pp.1-16, ⟨10.1101/546309⟩. ⟨hal-02435086v1⟩